Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zfp1P08042 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp1P08042 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms