Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csf1P07141 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms