Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TnfP06804 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TnfP06804 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TnfP06804 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TnfP06804 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TnfP06804 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TnfP06804 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TnfP06804 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms