Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoa4P06728 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms