Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2-AaP01910 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2-AaP01910 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms