Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01679 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01679 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01679 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01679 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01679 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01679 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
P01679 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01679 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01679 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01679 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms