Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01668 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01668 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01668 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01668 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01668 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms