Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01636 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01636 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01636 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01636 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01636 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01636 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01636 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01636 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01636 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01636 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01636 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01636 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01636 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms