Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ShdO88834 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ShdO88834 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ShdO88834 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ShdO88834 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ShdO88834 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ShdO88834 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ShdO88834 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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