Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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F11rO88792 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
F11rO88792 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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F11rO88792 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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F11rO88792 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
F11rO88792 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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F11rO88792 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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F11rO88792 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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F11rO88792 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
F11rO88792 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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