Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Capns1O88456 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Capns1O88456 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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