Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AvilO88398 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AvilO88398 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AvilO88398 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AvilO88398 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AvilO88398 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AvilO88398 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AvilO88398 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AvilO88398 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AvilO88398 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AvilO88398 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AvilO88398 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms