Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CaskO70589 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CaskO70589 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CaskO70589 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms