Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mid1O70583 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms