Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SgceO70258 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SgceO70258 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SgceO70258 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SgceO70258 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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