Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Chrna4O70174 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chrna4O70174 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms