Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Supt5hO55201 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Supt5hO55201 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms