Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn20O55082 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms