Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1bO55017 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms