Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc3O55013 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms