Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SlkO54988 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SlkO54988 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SlkO54988 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SlkO54988 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlkO54988 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlkO54988 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlkO54988 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlkO54988 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlkO54988 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms