Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f6O54917 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f6O54917 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
E2f6O54917 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f6O54917 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2f6O54917 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms