Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Srpk2O54781 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Srpk2O54781 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms