Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek2O35942 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek2O35942 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nek2O35942 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms