Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pik3cdO35904 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pik3cdO35904 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms