Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ppfibp2O35711 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms