Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npc1O35604 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npc1O35604 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npc1O35604 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms