Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E2f3O35261 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms