Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pkd2O35245 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pkd2O35245 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms