Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Psmd4O35226 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms