Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlhe40O35185 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms