Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Alx4O35137 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx4O35137 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Alx4O35137 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx4O35137 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Alx4O35137 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Alx4O35137 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Alx4O35137 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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