Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Scarb2O35114 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scarb2O35114 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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