Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barx2O08686 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Barx2O08686 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Barx2O08686 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms