Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna5O08543 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms