Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
MsmbO08540 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
MsmbO08540 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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