Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20878L7N244 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20878L7N244 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20878L7N244 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20878L7N244 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20878L7N244 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20878L7N244 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm20878L7N244 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20878L7N244 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms