Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm20939L7N243 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm20939L7N243 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms