Protein–RNA interactions for Protein: K7N769

2410141K09Rik, RIKEN cDNA 2410141K09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2410141K09RikK7N769 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
2410141K09RikK7N769 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2410141K09RikK7N769 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms