Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3402K7N5P2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3402K7N5P2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms