Protein–RNA interactions for Protein: J3S6Y1

Tspear, Thrombospondin-type laminin G domain and EAR repeat-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspearJ3S6Y1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TspearJ3S6Y1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms