Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm21310J3QQ23 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm21310J3QQ23 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm21310J3QQ23 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm21310J3QQ23 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm21310J3QQ23 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm21310J3QQ23 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21310J3QQ23 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21310J3QQ23 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21310J3QQ23 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm21310J3QQ23 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm21310J3QQ23 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21310J3QQ23 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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