Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shisa8J3QNX5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shisa8J3QNX5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms