Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Smim18J3QNP2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Smim18J3QNP2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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