Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17577J3QNF7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms