Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700014D04RikJ3QMS2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700014D04RikJ3QMS2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms