Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Gm20873J3QMQ9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm20873J3QMQ9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm20873J3QMQ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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