Protein–RNA interactions for Protein: I6XKQ3

Spdye4c, Speedy/RINGO cell cycle regulator family, member E4C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4cI6XKQ3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Spdye4cI6XKQ3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spdye4cI6XKQ3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spdye4cI6XKQ3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spdye4cI6XKQ3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spdye4cI6XKQ3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spdye4cI6XKQ3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spdye4cI6XKQ3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Spdye4cI6XKQ3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Spdye4cI6XKQ3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms