Protein–RNA interactions for Protein: G5E8H9

Rdh19, MCG134493, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh19G5E8H9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rdh19G5E8H9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh19G5E8H9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms