Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r12G5E8G1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r12G5E8G1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r12G5E8G1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r12G5E8G1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r12G5E8G1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r12G5E8G1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r12G5E8G1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r12G5E8G1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r12G5E8G1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms